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1953年，中国科学院决定在北京筹建综合性的化学研究所。

1956年，中国科学院化学研究所正式成立。

1994年，中国科学院化学研究所成为国家科技部和中国科学院基础性研究改革试点单位之一。

1998年，中国科学院化学研究所被列为首批进入中国科学院创新工程试点的单位之一。

1999年，中国科学院分子科学中心成立。

2003年，中华人民共和国科学技术部批准中国科学院化学研究所与北京大学共同筹建北京分子科学国家实验室。

2005年，中国科学院化学研究所被评为中国科学院A类研究所。

2006年，中国科学院化学研究所获全国学科评估化学学科最高分。

2015年，中国科学院分子科学科教融合卓越创新中心成立。

2016年，中国科学院批准依托化学所成立中国科学院分子科学科教融合卓越创新中心。

2017年，中华人民共和国科学技术部批准化学所与北京大学共同组建北京分子科学国家研究中心。

2018年，北京分子科学国家研究中心正式成立。

2025年7月，根据“中科院之声”官方信息，中国科学院化学研究所研究团队成功设计出具有长波长特性的新型荧光探针分子，该分子可使骨骼在荧光成像仪下清晰显像，为疾病诊断和药物监测开辟了新途径。

人员编制

截至2022年底，中国科学院化学研究所共有在职职工543人，包括中国科学院院士10人、发展中国家科学院院士6人、研究员119人、副高级专业技术人员288人；共有国家自然科学基金委创新群体12个；拥有国家杰出青年科学基金获得者50人，基金委优秀青年基金获得者37人，国家、院和所级引进优秀青年人才94人；拥有科技创新/创业领军人才14人、青年拔尖人才计划入选者9人；拥有创新人才推进计划中青年科技创新领军人才入选者8人、科技创新创业人才1人、重点领域创新团队5个。

中国科学院院士（专职）：朱起鹤、朱道本、白春礼、佟振合、姚建年、万立骏、江雷、赵进才、李永舫、韩布兴、刘云圻、李玉良

发展中国家科学院院士（专职）：万立骏、江雷、赵进才、刘云圻

设施资源

馆藏资源

据2023年10月图书馆官网数据，中国科学院化学研究所图书馆面积约为800平方米，拥有阅览座位100席；中西文图书藏书量约为3万册；中日西文期刊约600多种，合约5万册（过刊）；此外还收有化学所不完全的学位论文600册以及少量会议录。中西文图书定购量为近400册/年，中日西文期刊合订量约为1000本/年。

合作交流

2017年12月29日，廊坊市政府与中国科学院化学研究所合作签约仪式暨中国科学院科技成果推介会在廊坊市举办。

2023年4月6日，天津大学理学院与中国科学院化学研究所签署联合培养本科人才合作协议。

学科建设

据2023年10月研究所官网数据，中国科学院化学研究所是1981年国务院学位委员会首批批准的博士、硕士学位授予权单位之一，设有1个学术学位一级学科博士点、2个博士后科研流动站，2015年、2020年被评为全国优秀博士后科研流动站。

学术学位一级学科博士点：化学

博士后科研流动站：化学、材料科学与工程

教学建设

据2023年10月研究所官网数据，中国科学院化学研究所共有在学研究生1173人，其中博士阶段800人，硕士阶段373人；在站博士后194人。

形象标识

中国科学院化学研究所的所徽主体由一个圆形图案构成，象征化学所的团结和协作，也表示分子和原子的轨道，凸显化学学科的特点。2. 中英文所名环绕着一个大写的英文字母“C”，代表化学（Chemistry），中国（China）和中心（Center），寓意为化学是自然科学的中心学科，化学所要成为中国化学研究的中心，成为国际一流的研究所。

精神文化

创新，求是，团结，奉献

文化活动

2023年5月13日，中国科学院化学研究所举行了以“遇见科学，预见未来，化学创造美好生活”为主题的公众科学日活动。