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复旦大学附属华山医院创建于1907年，前身为中国人自办的中国红十字会总医院暨医学堂。1992年，医院首批通过国家三级甲等医院评审。2006年4月28日，浦东院区正式开业。2012年12月，宝山院区开业运行。2018年12月4日，被国家卫健委公布为首批肿瘤多学科诊疗试点医院。2021年5月1日，福建医院正式建成开诊。2024年7月，医院神经精神疾病联合创新中心成立；9月，被授予“上海市公立医院国际医疗旅游试点单位”。2025年5月6日，普外科急诊与综合外科中心成立；5月11日，与海南省人民医院合作共建的“复旦大学附属华山医院海南合作医院”及“海南省运动康复医学中心”正式揭牌。

截至2025年，现有总院、浦东、虹桥、宝山等多个院区，核定床位3142张、研究型床位450张，临床医技科室42个，拥有国家神经疾病医学中心、国家传染病医学中心和国家老年疾病临床医学研究中心。有卫生部国家临床重点专科20个，包括骨科、护理专科、检验科、内分泌科、神经外科等；教育部国家重点学科10个，国家重点实验室2个。现有职工近5000余人。虹桥院区占地100亩。

医院设有核定床位1216张，配有高清PET/CT、3.0术中磁共振、射波刀、伽马刀、256排CT、SPECT、DSA、电子束成像系统（EBIS）、彩色多普勒超声系统、氨气刀、超声刀、X-刀、震波碎石机、直线加速器等医疗设备。

2024年7月，复旦大学附属华山医院神经精神疾病联合创新中心成立。

2024年9月，华山医院被授予“上海市公立医院国际医疗旅游试点单位”，已完成“国际医疗部”挂牌工作，并集中设置国际医疗诊疗区域，试点医院国际医疗服务呈整体上升趋势。

2024年，该医院预算收入106亿元。

2024年12月6日，用于治疗慢性炎性脱髓鞘性多发性神经根神经病（CIDP）的靶向生物制剂艾加莫德皮下注射，在复旦大学附属华山医院开出了全国首张处方。这意味着该药正式进入临床应用，国内CIDP患者拥有了全新的治疗选择。

2025年3月4日据复旦大学消息，全球首批第4例、通过脑脊接口技术让瘫痪者重新行走的临床手术在复旦大学附属华山医院成功实施。

2025年5月6日，复旦大学附属华山医院普外科急诊与综合外科中心成立。5月11日，海南省人民医院与复旦大学附属华山医院合作共建的“复旦大学附属华山医院海南合作医院”及“海南省运动康复医学中心”正式揭牌。7月，复旦大学附属华山医院楚雄合作医院揭牌。

医院设有神经外科、手外科、神经病学、传染病学、中西医结合临床、泌尿外科、肾病科、心血管科、影像医学和核医学、普外科重点学科10个，骨科、护理专科、检验科、重点实验室（手外科）、重点实验室（抗生素）、内分泌科、神经外科、手外科、神经内科、中医专业（肺病）、皮肤科、泌尿外科、肾病科、外科、消化科、肿瘤科、感染科、康复医学科、运动医学科、医学影像科重点专科20个，临床药事、神经内科、皮肤科、激光治疗、核医学、职业病诊断、神经外科临床质控中心7个，WHO研究与培训合作中心1个，重点实验室、各类研究所、中心近20个。

郑宁：复旦大学附属华山医院党委书记

毛颖：复旦大学附属华山医院党委副书记、院长

刘金也：复旦大学附属华山医院党委副书记、纪委书记

顾宇翔：复旦大学附属华山医院党委副书记、工会主席

吕飞舟：复旦大学附属华山医院副院长

钦伦秀：复旦大学附属华山医院副院长

伍蓉：复旦大学附属华山医院副院长

管德坤：复旦大学附属华山医院副院长

徐文东：复旦大学附属华山医院副院长

夏云：复旦大学附属华山医院副院长

赵重波：复旦大学附属华山医院副院长

周海平：复旦大学附属华山医院总会计师

5G架构下超便携混合现实颅脑手术导航系统建设

本项目以复旦大学附属华山医院为中心，由上海电信5G赋能，协同构建5G医疗示范网，以神经外科疾病的治疗为导向，面向神经外科疾病建立AR可视化手术导航平台。采用5G、人工智能算法、边缘计算，全面分析进展性颅内出血风险因素和相关系数，创新变革传统开颅手术方案制定手段，精准实施手术，确保救治到位。

项目在5G+远程治疗领域提供良好的借鉴，培育可复制、可推广的5G智慧医疗健康新业态，旨在全面提升全国神经外科疾病的救治水平，探索我国神经外科疾病救治新模式。

2022年8月10日，该项目入选“2022年5G十大应用案例”。

2025年6月14日消息，中国科学院脑科学与智能技术卓越创新中心（赵郑拓研究组及李雪研究组）联合复旦大学附属华山医院（吴劲松/路俊锋团队），与相关企业合作，成功开展了中国首例侵入式脑机接口的前瞻性临床试验。该成果标志着我国在侵入式脑机接口技术上成为继美国之后，全球第二个进入临床试验阶段的国家，也是上海市脑机接口临床试验与转化重点实验室依托两家单位成立后的首项重要成果。

2018年12月4日，被国家卫健委公布为首批肿瘤多学科诊疗试点医院。

2020年9月，上海市委、市政府决定，授予其“上海市抗击新冠肺炎疫情先进集体”称号。

2021年10月，复旦大学附属华山医院神经内科被授予“2021年上海市工人先锋号”称号。

2024年5月13日，华山医院皮肤科荣获“2024年上海市工人先锋号”。

2025年5月23日，被中央宣传思想文化工作领导小组授予第七届全国文明单位称号。