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其前身可追溯至1917年美国洛克菲勒基金会创建的协和医学院图书馆，1974年与医学科学情报研究室合并组建医学情报研究所，1985年恢复为中国协和医科大学图书馆，1993年更名为医学信息研究所。1984年设立工具书阅览室，1988年启动计算机集成管理系统研究，逐步实现采编与流通自动化。2024年微信公众号更名为“协和图书馆”，服务内容保持不变。

1985年恢复中国协和医科大学，因与医学科学院是统一的领导机构,所以该馆也是协和医科大学图书馆。它是中国医学科学院和中国协和医科大学的医学文献中心。馆藏以生物、医学为主，截至到1990年底，共藏有中外文图书 11.88 万种，15.6 万册；各文种期刊 5000 种，22.6万册(合订本)，其中有数百种期刊是从创刊卷开始成套入藏的，如<英国皇家学会哲学会刊>、<英国医学杂志>等。图书馆设采编、期刊、流通、咨询、复制等室和一个分馆。该馆除为医科院所属各研究所、医院与协和医科大学师生员工服务外，还向院外医药卫生单位开放。服务方式以阅览、 复制、 外借为主，并负责向国内外有关单位索取复印件。

1984年成立咨询室，开辟了工具书阅览室,除开展用户教育、 答复读者咨询外,还设专人为读者开展计算机文献检索。 1985 年成立了“医学文献检索与利用”教研组，承担协和医科大学本科生、研究生的教学任务。1985年10月在长沙成立的中国高等医药院校图书馆协会，是医学院校图书馆的网络组织，该馆被选为协会的主任委员并承担协会秘书处的工作。1988年开始，该馆利用电子计算机进行图书馆集成管理的研究，现已完成采编数据库的建库工作。书刊流通的建库工作已在进行，计划于1995年实现图书馆工作全部自动化管理。此外,该馆还利用计算机编辑了<全国高等医药院校图书馆预订外文原版期刊联合目录>年刊。