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林文君，2012年进入厦门市水上运动中心，师从杨劲松教练开始划艇运动生涯。

2014年入选福建省皮划赛艇运动管理中心划艇队，2016年入选国家集训队。

2018年5月20日，2018年皮划艇世界杯匈牙利赛格德站，中国选手林文君/张璐琦以43.082秒夺得女子双人划艇200米冠军，创下中国女子划艇项目历史最好成绩。5月27日，皮划艇世界杯德国站比赛在德国杜伊斯堡落幕，女子双人划艇200米上，由林文君、张璐琦和张雅珏、王晶组成的两条双人划艇，包揽冠军和亚军。

2018年8月6日，雅加达亚运会中国代表团运动员名单公布，林文君入选第十八届亚运会中国体育代表团名单。

2019年8月25日，在匈牙利赛格德举行的2019年世界静水皮划艇锦标赛女子双人200米划艇决赛中，林文君和队友张璐琦夺得冠军。

2020年11月，在2020年全国皮划艇静水锦标赛暨2021年第十四届全国运动会皮划艇静水资格赛中，林文君获得女子200米单人划艇第1名、林文君和河北队张璐琦配艇获女子200米双人划艇第1名、500米双人划艇第2名。

2021年，林文君入选2020年东京奥运会中国体育代表团皮划艇项目运动员名单。

2021年8月4日，东京奥运会皮划艇静水女子200米单人划艇预赛，中国选手林文君获得小组第二，直接晋级半决赛。

2021年8月5日，在女子200米单人划艇半决赛中，林文君以47秒161拿下小组第二，成功晋级A组决赛 。

2021年8月5日，在东京奥运会皮划艇静水女子200米单人划艇决赛中，中国选手林文君以47.608的成绩获得第6名。

2021年9月23日，获得中华人民共和国第十四届运动会皮划艇静水-女子200米单人划艇比赛银牌。

当地时间2022年5月22日，皮划艇静水世界杯捷克拉齐采站结束，在女子双人划艇200米比赛中，林文君/帅常文获得银牌，林文君还在单人划艇200米比赛中摘得银牌。

2022年8月6日，2022年皮划艇（静水）世锦赛在女子双人划艇200米比赛中，中国组合林文君/帅常文组合以45秒24的成绩获得一枚银牌。当地时间8月7日，在加拿大达特茅斯举行的皮划艇（静水）世锦赛中，林文君斩获女子单人划艇200米铜牌。

2023年3月29日，在全国皮划艇静水春季冠军赛女子200米单人划艇决赛中，林文君以50秒791的成绩夺得冠军。5月12日，皮划艇世界杯匈牙利站女子200米双人划艇决赛，帅常文/林文君以44秒77的成绩收获一枚银牌，此外，林文君还获得女子单人划艇200米第四名。

2023年5月28日晚，2023年皮划艇静水世界杯第二站——波兰波兹南站比赛落下帷幕，在女子200米单人划艇项目上，林文君以47秒98的成绩获亚军；女子200米双人划艇项目，帅常文/林文君组合以46秒95夺冠。7月14日，2023年全国皮划艇静水锦标赛，在女子200米单人划艇项目中，福建女将林文君以45秒675的成绩夺冠，在女子200米双人划艇项目中，林文君和贵州选手帅常文以42秒344冲过终点夺冠。7月，林文君入选中国国家皮划艇队参加杭州第19届亚运会名单。8月15日，林文君入选德国世锦赛划艇项目参赛名单。8月25日，国际划联2023皮划艇静水世界锦标赛，林文君获得女子单人划艇200米比赛铜牌，同时获得该项目巴黎奥运会参赛资格；林文君与帅常文搭档摘得女子双人划艇200米的冠军。北京时间8月27日，世界皮划艇静水锦标赛女子500米四人划艇决赛，由李丽、万崟、林文君、帅常文组成的中国队以1分47秒186的成绩获得冠军。8月28日，皮划艇静水世锦赛暨巴黎奥运会资格赛，林文君在女子单人划艇200米项目中获得一铜，为中国队赢得一个2024年巴黎奥运会参赛席位，赢得巴黎奥运会参赛席位。9月1日晚间，国际皮划艇联合会2023皮划艇静水世界杯第三站在法国巴黎收官，林文君以45″61的成绩获得女子单人划艇200米项目冠军，为中国队再添一金。10月3日，在杭州第19届亚运会皮划艇静水女子200米单人划艇决赛，林文君以47.623的成绩获得冠军。10月3日，在杭州第19届亚运会女子200米双人划艇决赛中，林文君、帅常文组成的中国队以44.296的成绩夺得冠军。

2021年11月2日，入选福建省体育局公示的“第十四届全国运动会运动员教练员和有功集体-个人记功”拟表彰奖励名单。

2023年10月,荣获福建青年五四奖章。

2022年6月，被授予第六届“福建省直青年五四奖章”。

2023年10月，获评福建省三八红旗手称号。